

В условиях возможного ограничения доступа отечественного научного сообщества к мировым базам данных и знаний актуальной задачей является создание отечественных баз данных и инструментов для их эффективного анализа. Относительно электронных ресурсов наиболее актуальной задачей является хранение и обработка результатов ДНК-секвенирования, так как современные методы полногеномного секвенирования позволяют считывать миллиарды последовательностей ДНК за считаные часы. Проект нацелен на создание электронного ресурса для визуализированного анализа результатов полногеномного секвенирования и полной автоматизации работы комплекса программ по сборке и аннотации митохондриальных геномов, включая исторические геномы, полученные при анализе музейной ДНК.
Аннотированные геномы будут автоматически сохранятся в электронную базу данных и станут доступны для анализа другими пользователями нашей системы после даты, обозначенной автором загружаемых данных. Основным преимуществом этого проекта будет возможность проведения сравнительного анализа большого множества митохондриальных геномов в реальном времени.
Совместно с ООО «ЭЛЬГЕН»

Cовместно с Государственным Эрмитажем.
Палеогеномные исследования оказались ценным инструментом для изучения миграций древнего населения Евразии. Несмотря на обилие данных о последовательностях древних геномов человека (более 10 000), отношения внутри отдельных сообществ практически не исследовались. Знание о генетическом родстве людей, относящихся к конкретной древней популяции или погребенных на одном кладбище, предоставляет важные сведения о социальных структурах древних коллективов. Большинство палеогенетических исследований, касающихся родства между людьми, обычно ограничивалось однородительскими маркерами (митохондриальная ДНК или Y-хромосома), в то время как задачей полногеномных исследований был в основном широкий сравнительный анализ представителей различных популяций разных исторических периодов.
Этот проект направлен на изучение происхождения, родственных связей и генеалогии кочевников Тувы, чьи захоронения были обнаружены в так называемой Долине царей в Турано-Уюкской горностепной котловине в Пий-Хемском районе Республики Тыва. Здесь, в долине реки Уюк, исследована серия больших курганов с захоронениями людей самого высокого социального уровня и сопровождающих их лиц. В рамках проекта будет оценена степень родства древних кочевников, захороненных в погребально-поминальных комплексах Аржан-2 и Чинге-Тей.

Cовместно с Государственным Эрмитажем.
Определение родственных связей между людьми, связанными одним археологическим контекстом (например, погребенных в одном или нескольких могильниках, принадлежащих одной популяции), имеет большое значение для понимания социального устройства древних сообществ. Археологическое изучение захоронений часто дает представление о социальных и культурных связях между погребенными, но только генетический анализ может дать надежное определение их родства. В рамках междисциплинарных подходов существует возможность оценить биологические и культурные модели, которые характеризовали общества прошлого.
Проект направлен на детальное изучение палеогеномов людей, захороненных в могильном комплексе Оглахты (Южная Сибирь, Республика Хакасия) во II–IV вв. н. э., с целью выяснения степени родства между погребенными и структуры местного общества, отраженной в планиграфии оглахтинских погребений, а также происхождения этой новой для региона популяции.

Совместно с Зоологическим институтом РАН.
Этот проект направлен на использование современных методов геномики и биоинформатики для понимания причин и закономерностей вымирания животных и растений, с использованием методов современной геномики, биоинформатики, модифицированных методик выделения ДНК из музейного материала и достижения при исследовании экзогенной ДНК (enviromental DNA). Полученные в рамках исследований результаты в дальнейшем могут быть использованы для восстановления исторических видов и популяций.
Европейский университет в Санкт-Петербурге
191187, Санкт-Петербург, ул. Гагаринская, д. 6/1