меню
лаборатория
/

палегеномика

Heading

/

Heading

This is some text inside of a div block.
This is some text inside of a div block.
This is some text inside of a div block.
учебно-исследовательская лаборатория палеогеномики создана, чтобы подготовить специалистов в области музейного дела с навыками использования естественно-научных методов исследований биологических образцов, депонированных в музейные коллекции России
работаем с ДНК, извлеченной из антропологического материала, а также тканей вымерших животных и растений

разрабатываем новые методы биоинформатического анализа генетических данных, которые получаются при расшифровке геномов.
/проекты
1

numenius: база данных аннотированных геномов органелл

В условиях возможного ограничения доступа отечественного научного сообщества к мировым базам данных и знаний актуальной задачей является создание отечественных баз данных и инструментов для их эффективного анализа. Относительно электронных ресурсов наиболее актуальной задачей является хранение и обработка результатов ДНК-секвенирования, так как современные методы полногеномного секвенирования позволяют считывать миллиарды последовательностей ДНК за считаные часы. Проект нацелен на создание электронного ресурса для визуализированного анализа результатов полногеномного секвенирования и полной автоматизации работы комплекса программ по сборке и аннотации митохондриальных геномов, включая исторические геномы, полученные при анализе музейной ДНК.

Аннотированные геномы будут автоматически сохранятся в электронную базу данных и станут доступны для анализа другими пользователями нашей системы после даты, обозначенной автором загружаемых данных. Основным преимуществом этого проекта будет возможность проведения сравнительного анализа большого множества митохондриальных геномов в реальном времени.

Совместно с ООО «ЭЛЬГЕН»

подробнеее
1

долина царей: палеогеномика ранних кочевников Тувы

Cовместно с Государственным Эрмитажем.

Палеогеномные исследования оказались ценным инструментом для изучения миграций древнего населения Евразии. Несмотря на обилие данных о последовательностях древних геномов человека (более 10 000), отношения внутри отдельных сообществ практически не исследовались. Знание о генетическом родстве людей, относящихся к конкретной древней популяции или погребенных на одном кладбище, предоставляет важные сведения о социальных структурах древних коллективов. Большинство палеогенетических исследований, касающихся родства между людьми, обычно ограничивалось однородительскими маркерами (митохондриальная ДНК или Y-хромосома), в то время как задачей полногеномных исследований был в основном широкий сравнительный анализ представителей различных популяций разных исторических периодов.

Этот проект направлен на изучение происхождения, родственных связей и генеалогии кочевников Тувы, чьи захоронения были обнаружены в так называемой Долине царей в Турано-Уюкской горностепной котловине в Пий-Хемском районе Республики Тыва. Здесь, в долине реки Уюк, исследована серия больших курганов с захоронениями людей самого высокого социального уровня и сопровождающих их лиц. В рамках проекта будет оценена степень родства древних кочевников, захороненных в погребально-поминальных комплексах Аржан-2 и Чинге-Тей.

подробнеее
1

происхождение и родственные связи людей археологического памятника Оглахты

Cовместно с Государственным Эрмитажем.

Определение родственных связей между людьми, связанными одним археологическим контекстом (например, погребенных в одном или нескольких могильниках, принадлежащих одной популяции), имеет большое значение для понимания социального устройства древних сообществ. Археологическое изучение захоронений часто дает представление о социальных и культурных связях между погребенными, но только генетический анализ может дать надежное определение их родства. В рамках междисциплинарных подходов существует возможность оценить биологические и культурные модели, которые характеризовали общества прошлого.

Проект направлен на детальное изучение палеогеномов людей, захороненных в могильном комплексе Оглахты (Южная Сибирь, Республика Хакасия) во II–IV вв. н. э., с целью выяснения степени родства между погребенными и структуры местного общества, отраженной в планиграфии оглахтинских погребений, а также происхождения этой новой для региона популяции.

подробнеее
1

«шестое вымирание»

Совместно с Зоологическим институтом РАН.

Этот проект направлен на использование современных методов геномики и биоинформатики для понимания причин и закономерностей вымирания животных и растений, с использованием методов современной геномики, биоинформатики, модифицированных методик выделения ДНК из музейного материала и достижения при исследовании экзогенной ДНК (enviromental DNA). Полученные в рамках исследований результаты в дальнейшем могут быть использованы для восстановления исторических видов и популяций.

подробнеее
/партнеры
контакты

Телефон/факc

+7 (812) 386-7635

артем недолужко
оуководитель лаборатории

anedoluzhko@eu.spb.ru

Европейский университет в Санкт-Петербурге
191187, Санкт-Петербург, ул. Гагаринская, д. 6/1